丙酮酸脱氢酶(PDH)与肿瘤放疗抵抗:ACAT1巴豆酰化如何通过PDHA1磷酸化影响乳酸代谢
发表在《Communications Biology》上的一项研究,把近年受到关注的一类翻译后修饰——巴豆酰化——和肿瘤放疗抵抗的代谢机制联系了起来。
这项研究最后同样落到了PDH这个代谢节点上,但和④心肌肥厚那篇的调控路径完全不同。这里主要看看这条机制是怎么建立起来的,以及PDH活性检测在其中起了什么作用。
放疗后,为什么部分肿瘤细胞会变得更耐受
此前已经有不少研究发现,电离辐射引起的糖代谢变化与放疗抵抗有关。放疗后存活下来的肿瘤细胞,往往表现出更强的糖酵解倾向,同时伴随乳酸产量升高。
问题在于,这种代谢转向究竟是怎么被启动的,还没有完全解释清楚。
这项研究关注的就是电离辐射之后发生的分子变化:哪些修饰发生了改变,又是怎么一步步把丙酮酸代谢推向乳酸生成的。
电离辐射后,ACAT1 K181位点巴豆酰化升高
作者首先做了巴豆酰化蛋白质组学分析,比较电离辐射前后细胞内巴豆酰化修饰谱的变化。结合KEGG通路富集分析,他们筛出了一批与糖代谢有关的差异巴豆酰化蛋白,其中ACAT1(乙酰辅酶A乙酰转移酶1)的K181位点比较突出。
在MCF7(乳腺癌)、HeLa(宫颈癌)等细胞系中,8 Gy电离辐射处理后4小时,ACAT1巴豆酰化水平明显升高,而且从0到8 Gy呈剂量依赖性增加。
接下来,作者筛查了几种常见的巴豆酰转移酶,发现GCN5(KAT2A)负责ACAT1这一位点的巴豆酰化。过表达GCN5能够剂量依赖性地提高ACAT1巴豆酰化水平;敲低GCN5后,电离辐射诱导的ACAT1巴豆酰化明显减弱。
免疫共沉淀和邻近连接实验(PLA)也显示,电离辐射后GCN5与ACAT1之间的相互作用增强。
ACAT1的变化,最后会影响PDHA1
ACAT1的经典功能是催化乙酰辅酶A的硫解反应,参与脂肪酸氧化和酮体代谢。此前的研究还发现,ACAT1可以作为PDHA1(丙酮酸脱氢酶E1α亚基)的乙酰化转移酶。
PDHA1乙酰化后,更容易招募PDH激酶,随后PDHA1发生磷酸化,PDH活性受到抑制。这里“乙酰化促进激酶招募”的机制来自此前的研究,并不是这篇论文首次提出。
这篇研究继续追问:ACAT1本身发生巴豆酰化后,会不会影响它的催化能力?
实验结果显示,K181巴豆酰化会增强ACAT1酶活性。这里检测的是ACAT1自身的硫解酶活性,通过监测303 nm处的吸光度变化进行判断,与后面的PDH活性检测不是同一套体系。
ACAT1活性增强后,对PDHA1的乙酰化也随之增加。与此同时,PDHA1 S293位点的磷酸化水平升高,最终使PDH催化活性下降。
也就是说,这里可以看到这样一条关系:
GCN5介导ACAT1 K181巴豆酰化 → ACAT1活性增强 → PDHA1乙酰化增加 → PDHA1 S293磷酸化升高 → PDH活性下降。
这部分功能验证使用了PDHA1活性检测,即CheKine™ 丙酮酸脱氢酶活性检测试剂盒(KTB1270)。
作者分别检测ACAT1自身活性和下游PDHA1活性:前者确认巴豆酰化确实改变了ACAT1的催化能力,后者再判断这种变化是否进一步影响PDH功能。两项检测针对的是不同层级的问题,不能混为同一种酶活实验。
PDH活性下降后,更多丙酮酸流向乳酸
PDH活性受到抑制后,丙酮酸进入三羧酸循环的通路受限,更多丙酮酸转而被乳酸脱氢酶还原为乳酸。
作者在细胞实验中观察到,电离辐射处理后胞内乳酸水平明显升高,其变化与ACAT1 K181巴豆酰化及PDHA1磷酸化的时间过程相吻合。
如果课题中需要复现类似的代谢转向,除了测PDH活性,还可以同时关注底物丙酮酸和乳酸水平。例如,可以分别使用丙酮酸检测试剂盒(KTB1121)和乳酸检测试剂盒(KTB1100),从底物、PDH活性和乳酸生成三个层面观察代谢变化。
这里需要区分论文结果和实验设计建议:上述两个货号是针对同类实验的检测建议,不代表原论文使用的就是这两个产品。论文中丙酮酸和乳酸检测具体使用的品牌目前没有确认。
把K181位点改掉后,放疗敏感性发生了变化
为了判断K181巴豆酰化是否直接参与这条调控通路,作者构建了ACAT1 K181R突变体,把该位点的赖氨酸替换成精氨酸,以模拟不能发生巴豆酰化的状态。
结果显示,携带K181R突变的细胞对电离辐射更加敏感,同时,电离辐射诱导的乳酸升高也明显减弱。
作者还进行了裸鼠异种移植瘤实验。K181R突变体来源的肿瘤生长速度更慢,对放疗也表现出更高的敏感性。
细胞实验和体内实验的结果方向一致,支持ACAT1 K181巴豆酰化参与调节肿瘤细胞的放疗耐受。
PDH在这条通路里处于什么位置
把整套实验连起来看,这项研究建立的是这样一条调控路径:
电离辐射 → GCN5介导ACAT1 K181巴豆酰化 → ACAT1活性增强 → PDHA1乙酰化增加 → PDHA1 S293磷酸化升高 → PDH活性下降 → 乳酸生成增加 → 放疗耐受增强。
和④心肌肥厚那篇相比,两项研究的上游调控方式并不一样:一项涉及脂肪因子驱动的蛋白稳定性调控,这一项则从电离辐射诱导的巴豆酰化出发。但两条路径最后都需要通过PDH活性的变化来确认代谢功能是否真的受到影响。
因此,如果研究的问题是“某种上游修饰或信号是否最终改变了丙酮酸氧化代谢”,PDH活性检测可以作为其中一个直接的功能读数。再结合丙酮酸、乳酸等代谢物检测,可以进一步判断PDH变化之后的代谢流向。
对于巴豆酰化、琥珀酰化等酰基化修饰与代谢酶功能交叉的课题,这篇论文的实验顺序也比较清楚:先确认修饰变化,再检测酶活性,随后观察代谢表型,最后通过细胞和动物实验验证其功能后果。
原理、选购和实操层面的基础内容,可以回头看《PDH丙酮酸脱氢酶活性检测试剂盒怎么选?几个容易踩的坑》《PDH丙酮酸脱氢酶活性检测原理:DCPIP 比色法怎么测出酶活性》和《PDH丙酮酸脱氢酶活性检测实验方案:从样本制备到数据计算的完整流程》。
