脂肪酸合成酶活性检测实验方案:FAS活性检测试剂盒操作全流程详解
做代谢实验有一个很现实的问题:很多操作细节,说明书上写了,但写得很简略;没写的,你得靠经验或者问师兄师姐。等到数据出来之后发现不对,再往回追,才知道问题出在哪个步骤。
这篇文章的目的是把FAS活性检测的完整流程,从试剂准备到最后出结果,逐环节讲清楚。用的是比色法(NADPH消耗法),以96孔UV板为检测平台,参考亚科因生物KTB2240(CheKine™脂肪酸合成酶活性检测试剂盒,微量法)的实际操作方案。如果你正在建立这个检测体系,或者之前做过但数据一直不稳定,这篇文章应该能帮你理清楚。
先把原理说清楚,操作才能做到知其然知其所以然
FAS(脂肪酸合成酶)是脂肪酸合成的关键酶,催化乙酰辅酶A和丙二酰辅酶A合成长链脂肪酸,这个过程不可逆地消耗NADPH。NADPH在340 nm处有特征吸收峰,而它的氧化产物NADP⁺没有。因此,在含有FAS的样本里加入底物,340 nm处的吸光度就会随着NADPH的消耗而持续下降,下降的速率与FAS的活性成正比——这就是整个检测体系的核心逻辑。
理解了这个原理,后面很多操作细节就不再是"说明书要求这样做",而是"不这样做结果会错在哪里"。比如工作液为什么要在37℃预孵育,因为底物需要在接近生理温度的条件下充分活化,酶促反应才能在加入样本后迅速稳定地启动;为什么要在60秒的时间窗内完成读数,因为这段时间内NADPH消耗与FAS活性呈线性关系,超出这个窗口,底物浓度下降过多,反应速率开始偏离线性,计算出来的活性就不准了;为什么必须用UV板,因为普通聚苯乙烯板在340 nm波段几乎不透光,背景干扰会把信号完全掩盖。
这些细节知道原因之后,做实验时就不会随意取舍了。
在动手之前,先把这几件事确认好
正式开始之前有几个前提条件,是真的会影响结果的。
第一,酶标仪必须能测340 nm。这个波长不是所有仪器标配,有些低端机型只支持可见光波段,碰上这种情况只能换仪器。酶标仪需要提前预热,至少30分钟,不然早期孔和晚期孔之间会有系统性的温度漂移,影响吸光度读数的稳定性。
第二,板子必须是UV板(紫外透明板)。原因上面已经说了,不再重复。
第三,实验前先确认各组分的量。KTB2240里包含Extraction Buffer、Assay Buffer、NADPH、Acetyl CoA、Malonyl CoA五个组分,收到货后先逐一清点,确认包装完好、量足够用。三种底物都是粉末,开封之前先摇一摇,确认瓶子里有东西。
第四,准备好冰盒和预冷的PBS。样本处理全程在冰上进行,这不是可选项。FAS是酶,离开低温环境活性下降很快,室温操作基本上是在破坏你要检测的东西。
试剂准备:提前一天开始,不是当天早上临时搞
Extraction Buffer
从-20℃取出,提前一天放到4℃慢慢解冻,使用前从冰箱拿出来平衡到室温,轻柔颠倒混匀。当天早上才从-20℃拿出来强制解冻的问题是解冻不均匀,底部和表面的浓度会有差异,提取效率也会受影响。提前一天,冷藏慢解冻,才是正确操作。
Assay Buffer
4℃保存,使用前平衡到室温。这个试剂有一定刺激性,操作过程中戴手套,不要直接接触皮肤。Assay Buffer在底物溶解和工作液配制里都会用到,是使用频率最高的组分,提前确认有没有足够的量。
Working NADPH
临用前配制,不要提前。48T规格加入0.984 mL Assay Buffer到NADPH粉末瓶中,充分溶解;96T规格加入1.968 mL。溶解后放在冰上避光保存——NADPH见光会降解,在荧光灯下放十几分钟就会有肉眼可见的颜色变化。用不完的Working NADPH要分装到避光管,-20℃保存,两周内用完,不能反复冻融。
Working Acetyl CoA
临用前配制。48T加入0.264 mL Assay Buffer,96T加入0.528 mL。溶解后冰上避光放置,保存方式和Working NADPH一样。
Working Malonyl CoA
48T加入0.504 mL Assay Buffer,96T加入1.008 mL。这三种底物的配制都需要充分溶解,粉末完全溶解之前不要开始用。如果瓶底还有未溶的粉末,轻弹瓶壁再等一会儿,不要剧烈涡旋,容易产生气泡影响后续操作。
三种底物都配好之后,放在冰上避光待用。
样本制备:不同来源的样本,处理方式差别很大
这一部分是整个实验里出问题最多的环节,也是最需要根据自己样本类型仔细操作的地方。
动物组织
称取约0.1 g组织,放入匀浆管,加入1 mL Extraction Buffer,在冰浴条件下匀浆。匀浆要充分,但不要过度——过度匀浆会产生大量热量,局部温度升高会影响酶活性。
匀浆完成后12000 g、4℃离心40分钟,小心取出离心管,吸取上清放在冰上备用。
对于脂肪含量较高的组织,比如肝脏、肾上腺、脂肪组织,离心之后上层会有一层肉眼可见的白色脂肪。这层脂肪一定要在吸取上清之前先小心去掉,不能混入后续的检测样本。如果不去掉,脂肪层会在检测体系里造成严重干扰,ΔA值会完全不可靠。实际操作时可以先把离心管倾斜,让脂肪层聚集在一侧,再从另一侧吸取上清,动作要轻,不要吸入脂肪。
如果你用的是植物来源样本,需要特别注意另一个问题:某些植物组织含有较多的内源性还原性物质,这些物质本身在340 nm处可能就有一定的背景吸光度,后面对照设置那一节会详细说怎么处理。
植物组织
称取约0.1 g样本,加入1 mL Extraction Buffer,先机械捣碎,再进行超声破碎。超声参数:功率20%或200 W,超声3秒、间隔7秒、重复30次,全程冰浴。超声结束后12000 g、4℃离心40分钟,取上清。
植物组织细胞壁的存在让机械匀浆单独使用往往不够充分,超声步骤不能省。超声时注意探头不要直接接触管壁,超声管要放在碎冰中,保证样本在整个超声过程里维持低温。
细胞样本
收集5×10⁶个细胞,加入预冷的PBS清洗细胞两次,目的是去掉培养基成分,避免后续检测受到干扰。清洗之后800 g离心2分钟,尽量吸干上清,不要残留PBS。
加入1 mL Extraction Buffer,冰浴超声破碎,参数和植物组织一样:功率20%或200 W,超声3秒、间隔7秒、重复30次。之后4℃、12000 g离心40分钟,取上清置于冰上待测。
贴壁细胞收集的时候注意胰酶消化要彻底,否则收集效率偏低,实际细胞数会比你估计的少,ΔA值也会偏低。
细菌样本
与细胞样本处理方式基本一致。收集细菌后用预冷PBS清洗,800 g离心2分钟,去上清,加入1 mL Extraction Buffer超声裂解,之后12000 g、4℃离心40分钟取上清。
细菌细胞壁比动物细胞厚得多,超声裂解效率有时不够充分,如果ΔA值偏低,可以适当延长超声时间或者增加重复次数,全程控温。
血清和血浆
这是五类样本里操作最简单的,直接取样加入检测体系,不需要任何前处理。血浆样本如果有凝块,可以低速离心去除,取上清直接检测。
但需要注意的是,严重溶血的血清在340 nm处会有较强的背景吸光度,这种情况下单纯设置空白对照是不够的,最好另外设置一个样本背景对照,具体做法在后面对照设置那一节会说。
工作液的配制和预孵育,这一步比你想象的重要
所有样本处理完毕,在开始加样之前,先配好工作液,然后让它在37℃孵育至少15分钟。
每孔的工作液组成是:
Working NADPH:16 µL
Working Acetyl CoA:4 µL
Working Malonyl CoA:8 µL
Assay Buffer:152 µL
合计:180 µL
根据需要检测的样本数量按比例放大,多配5-10%,避免最后几个孔不够用。工作液现配现用,配完之后立刻放在37℃预孵育,不要放冰上等。
这个预孵育步骤直接决定了反应启动的效率。NADPH、Acetyl CoA和Malonyl CoA需要在接近生理温度的条件下充分活化,混合之后才能在加入含FAS的样本时迅速建立稳定的酶促反应体系。省掉这步,或者孵育时间不够,反应启动会有延迟,60秒的检测窗内能捕捉到的ΔA会系统性偏低。有时候ΔA只有0.0003或者0.0004,反复检查样本、反复调整取样量,折腾半天,最后才想起来是工作液没有预孵育——这种事情真的发生过。
配好工作液开始预孵育之后,这15分钟可以用来做最后的准备:酶标仪预热好了吗?UV板拿出来了吗?移液器校准了吗?多通道移液器如果有的话,这时候装好枪头,后面加样会快很多。
对照设置:比说明书写的更完整的版本
这是一个说明书层面往往覆盖不到、但在真实实验里必须认真对待的问题。
空白对照(试剂背景)
用Extraction Buffer代替样本上清,加入180 µL工作液,同步读340 nm吸光度。正常情况下空白孔的ΔA应该非常小,接近零,说明工作液本身的背景变化可以忽略。如果空白ΔA很大,说明试剂有问题——比如NADPH自发降解、有氧化性污染物混入,这批数据就不可靠,需要重新检查试剂状态。
样本背景对照(针对特殊样本)
对于某些特殊样本——严重溶血的血清、含有大量内源性还原性物质的植物组织提取物、某些颜色较深的细菌裂解液——样本本身在340 nm处就有一定的吸光度,甚至会有自发的吸光度变化,这部分信号和NADPH消耗无关,但会叠加在ΔA里,让计算出来的酶活偏高。
处理这类样本时,建议额外设置一个"样本+无底物背景液"的对照孔。背景液的配制方式是用Assay Buffer代替工作液中的三种底物,其他比例不变,加入20 µL样本和180 µL背景液,同样读A₁和A₂,计算ΔA背景。最终用于计算酶活的ΔA = ΔA测 - ΔA背景,扣除样本自身的非特异性吸光度变化,结果才是可靠的。
如果你做的是比较常见的动物组织或细胞样本,通常不需要这个额外对照;但如果是第一次用某种来源的样本,或者看到空白对照正常但组内重复性还是很差,就值得考虑是不是样本背景干扰在作怪。
检测体系的建立:加样顺序和操作节奏都有讲究
工作液预孵育完成,可以开始建立检测体系。
在96孔UV板的每个检测孔里,依次加入:
样本上清:20 µL
工作液:180 µL
合计:200 µL
加样顺序:先加样本,再加工作液。加完工作液之后立刻混匀——用酶标仪的振板功能,或者轻轻用手拍打板框侧面,不要用移液器反复吹打,会产生气泡,影响340 nm的读数。
混匀完成后立即开始检测。记录第10秒时的吸光度作为A₁,第70秒时的吸光度作为A₂。
如果同时跑的孔比较多,加样和混匀的时间会比较长,导致不同孔从加入工作液到开始读数的时间间隔不一样。这种时间差积累下来,会让不同孔的ΔA值之间产生系统性偏差。解决办法是合理分批,每批处理的孔数控制在能在1-2分钟内完成加样和混匀的范围内,加完一批就立即开始这批的读数,不要等整板都加完再统一读。使用多通道移液器可以显著提高效率。
吸光度数据的读取和初步判断
检测完成,拿到A₁和A₂两个读数,首先计算ΔA = A₁ - A₂。
在看结果之前,先做一个基本的合理性判断。
如果ΔA小于0.0005,信号基本淹没在背景噪音里,这个数据没有意义。出现这种情况,先排查几个可能的原因:样本提取是否充分?细胞是否充分裂解?工作液是否预孵育了足够时间?底物NADPH活性是否还正常?如果以上都没问题,可以适当增加上样量,从20 µL增加到25或30 µL,重新检测。
如果ΔA大于0.4,说明样本中FAS活性很高,信号超出了线性范围,检测结果不可靠。需要用Extraction Buffer稀释样本之后重新检测,直到ΔA落在合理范围内。
正式大批量检测之前做一轮预实验是必要的——KTB2240的每个组分都额外提供了10%的量,专门用于预实验,选2-3个预期差异较大的样本先跑一轮,摸清楚ΔA的大致范围,再决定最终的上样量和稀释倍数。跳过预实验直接大批量跑的,出了问题就是整批重做。
结果计算:四种方式,用哪个取决于你的实验设计
拿到ΔA之后,根据实验设计选择合适的归一化方式。
以下公式及其中的常数3215,是基于KTB2240(Abbkine)的特定检测体系推导出来的——反应总体积200 µL、96孔UV板光径0.5 cm、NADPH摩尔消光系数6.22×10³ L/mol/cm、反应时间1 min、样本加入量20 µL。这套公式只适用于完全按照KTB2240说明书搭建的检测体系,如果你修改了体系参数,比如改变了上样量、换了板子或调整了工作液比例,必须重新推导综合常数,不能直接套用3215这个数值。
按样本质量计算(最常用于组织样本)
活性单位定义:每克组织每分钟氧化1 nmol NADPH为1个酶活单位。
FAS酶活(U/g鲜重)= 3215 × ΔA ÷ W
W是样本质量(g)。
以KTB2240说明书里的实际示例为参考:0.1 g小鼠脾脏,ΔA = 0.0021,代入公式:3215 × 0.0021 ÷ 0.1 = 67.52 U/g。这个数值是有文献可以对标的,可以用来判断自己的数据是否在合理范围内。
按细胞或细菌数量计算
活性单位定义:每10⁴个细胞或细菌每分钟氧化1 nmol NADPH为1个酶活单位。
FAS酶活(U/10⁴)= 3215 × ΔA ÷ N
N是细胞或细菌数量,以10⁴为单位。收集了5×10⁶个细胞,N就是500。
按液体体积计算(适用于血清血浆)
活性单位定义:每毫升样本每分钟氧化1 nmol NADPH为1个酶活单位。
FAS酶活(U/mL)= 3215 × ΔA
血清血浆直接加20 µL进去检测,已经是标准上样量,直接套公式即可。
按蛋白浓度计算(推荐用于细胞和组织样本的组间比较)
活性单位定义:每毫克蛋白每分钟氧化1 nmol NADPH为1个酶活单位。
FAS酶活(U/mg prot)= 3215 × ΔA ÷ Cpr
Cpr是样本上清的蛋白浓度(mg/mL)。
亚科因生物官网技术中心提供了配套的在线计算工具,输入ΔA和相应的样本参数,自动给出酶活结果,多个样本可以批量输入,比手工算省事,也不容易抄错数字。
蛋白定量:为什么这一步不能省
很多实验者做到FAS酶活数据之后就停了,直接拿原始数据比组间差异,但这样做在很多情况下是不严谨的。
不同组织取样量再精确,实际的细胞含量也会有差异。不同处理组的细胞,培养状态不同,收集效率不同,加入1 mL裂解液之后,每毫升上清里实际含有多少蛋白是不一样的。如果直接比FAS活性,一部分差异可能来自FAS本身的变化,另一部分可能只是因为这管上清里蛋白多一点、那管少一点,两者叠加在一起解释起来就很麻烦。
按蛋白浓度归一化,是消除这种混淆因素的标准做法。推荐使用BCA法进行蛋白定量,方法成熟,兼容性好,对常见的裂解液成分干扰耐受性强。亚科因生物有配套的蛋白定量试剂盒(KTD3001,BCA法),可以和KTB2240配合使用,用同一批上清同时做蛋白定量和FAS活性检测,减少因为前处理不一致带来的误差。
整个流程的时间规划
做一次FAS检测,时间到底花在哪里,能不能在一天内完成?
提前一天:Extraction Buffer从-20℃移到4℃解冻。
实验当天:首先让酶标仪预热30分钟以上,同时Assay Buffer从4℃拿出来平衡室温。处理样本,组织匀浆、超声裂解或直接取血清,12000 g、4℃离心40分钟。离心这40分钟里,配制三种Working底物,避光冰上放置。
离心结束,取上清,冰上放置。配制工作液,放入37℃孵育15分钟以上。这15分钟里做最后的准备,排好UV板,调好移液器,检查酶标仪参数设置。
工作液孵育好,开始加样、混匀、读数。读数过程根据样本量,通常在15-30分钟内完成。
整个流程下来,如果样本量不大(48孔以内),一个人操作从开始到拿到ΔA数据,大概需要3-4小时。样本量大的时候,合理分批处理,用多通道移液器提高加样效率,通常一天可以完成。
一些真实操作中容易出现的问题
ΔA值不稳定,同一个样本复孔差异很大
最常见的原因是混匀不够。加完工作液之后,混匀这个动作很容易被低估——酶标仪的振板功能如果时间不够,或者振幅不够,样本和工作液没有充分接触,就会影响反应启动的速度。另一个原因是加样的时候移液器枪头有气泡,导致实际加入量和设定量有偏差。
ΔA值正常但组间没有差异,或者差异方向和预期相反
这种情况首先排查样本处理是否一致——不同组的组织在取样重量、离心条件、上样体积上有没有做到标准化。其次看蛋白浓度归一化有没有做,有时候原始ΔA数据没差异,按蛋白归一化之后差异就出来了;有时候原始有差异,归一化之后消失了,这说明之前观察到的差异其实是样本量的差异,不是FAS活性本身的差异。再往深查,如果仍然找不到原因,考虑设置样本背景对照,排查是否有内源性干扰物在影响结果。
第一次做出来的数据感觉偏低,和文献里的数值差很多
先确认公式用对了,单位换算没有搞错,确认用的是Abbkine KTB2240配套的计算体系,常数3215没有搬到其他体系里用。然后看样本取量和细胞数量是否足够。再检查工作液是否做过预孵育,底物溶解是否完全。多数情况下这几个因素能覆盖掉ΔA偏低的问题。
实验完成之后的数据记录和试剂收纳
读完数据,第一件事是立刻保存原始读数文件,不要依赖手动记录。把A₁、A₂的完整孔板数据导出,保留原始文件,再另建一个表格做ΔA计算和酶活换算。
用剩的Working底物,如果量还够下次用,分装到避光Eppendorf管,标好日期,-20℃保存,两周内用完,禁止反复冻融。Assay Buffer放回4℃,Extraction Buffer按使用量分装后剩余的重新放回-20℃。
批号信息要记录在实验记录本里。不同批次的组分之间不能混用,这是真实的批间活性差异问题,混用会让数据失去可比性。
用这套方法能做什么样的研究
FAS活性检测是脂代谢表型分析的基础指标之一。用KTB2240做出来的数据,已经出现在弥漫大B细胞淋巴瘤的脂代谢靶点研究(发表于Leukemia)、创伤性脑损伤后小胶质细胞脂滴蓄积与神经炎症的机制研究、糖尿病肾病中线粒体功能障碍的代谢表型分析、HSV-1感染动态的病毒代谢研究(发表于PLoS Pathogens)以及PET微塑料对胰腺脂毒性影响的研究中。这些文献横跨肿瘤、神经科学、代谢疾病、病毒感染和环境毒理五个方向,说明这套检测体系的适用范围相当宽,不是只能在特定样本类型或特定疾病模型里用。方法在文献里有记录,投稿时引用方法来源,审稿人是有迹可循的。
最后说一点
做酶活检测,每一个环节都是相互关联的。提取液没解冻好,提取效率就低;工作液没预孵育,反应启动就慢;UV板用错,背景噪音把信号淹没;特殊样本没设背景对照,ΔA里掺了干扰信号你都不知道;蛋白没归一化,组间比较就不公平。任何一个环节出问题,最后的数据都可能是错的,而且你不一定能马上看出来是哪里错了。
FAS活性是脂代谢研究里一个重要的功能性指标,把检测做扎实,数据才能支撑得起后续的机制分析和文章论证。
