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应用指南 2026-08-18 阅读

PK丙酮酸激酶活性检测原理:测NADH为什么能算出PK活性?

前言:一个让新手困惑的问题

第一次做PK活性检测的研究者,往往会产生同一个疑问:

试剂盒检测的明明是NADH,为什么最终算出来的是PK的活性?PK和NADH之间有什么关系?

这个问题问到了这类检测方法的核心——耦联酶法(Coupled Enzyme Assay)。弄清楚这个原理,不仅能帮你理解实验中每一步操作"为什么这么做",还能在数据出现异常时快速定位问题在哪个环节。


第一步:PK到底催化什么反应?

丙酮酸激酶(Pyruvate Kinase,PK,EC 2.7.1.40)催化糖酵解通路的最后一步反应:

磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)+ ADP → 丙酮酸 + ATP

这个反应有两个产物:ATP和丙酮酸。

ATP是细胞能量货币,直接检测难度高,且体系中存在大量内源ATP干扰;丙酮酸是有机小分子,在340 nm附近没有特异性吸光信号,直接比色的灵敏度很低。

换句话说,PK的直接产物没有一个适合高灵敏度比色检测的。 这就是为什么需要引入耦联酶——用另一个反应把丙酮酸"翻译"成可以精确测量的信号。


第二步:LDH做了什么?——把"看不见"的丙酮酸转化为可测信号

试剂盒中包含一个关键组分:乳酸脱氢酶(LDH)

LDH催化的反应是:

丙酮酸 + NADH + H⁺ → 乳酸 + NAD⁺

这个反应以丙酮酸为底物,同时消耗一分子NADH。也就是说,PK每生成一分子丙酮酸,LDH就随即消耗一分子NADH

两步反应串联起来,完整的信号传导链条是:

PEP + ADP ──[PK]──→ 丙酮酸 + ATP
丙酮酸 + NADH ──[LDH]──→ 乳酸 + NAD⁺
                    ↑
             这里的NADH消耗量
             与PK的催化速率
               严格等比例

结论:NADH的消耗速率 = 丙酮酸的生成速率 = PK的催化速率。 测NADH,本质上就是在测PK的活性,两者通过化学计量学严格对应,1:1关系,不需要任何换算系数。


第三步:NADH为什么在340 nm有信号?

NADH(还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)的腺嘌呤环在340 nm处有特征性紫外吸收峰,摩尔消光系数为 ε = 6.22×10³ L/mol/cm,这是生化领域最精确的物理常数之一,被广泛用于以NADH为报告分子的酶活检测体系。

NAD⁺(氧化型)在340 nm处几乎没有吸光度。

因此,当体系中的NADH逐渐被LDH氧化为NAD⁺时,340 nm处的吸光度会持续单调下降。吸光度下降的幅度,直接反映了NADH被消耗的量,进而反映了PK催化生成了多少丙酮酸,最终反映了样本中PK的活性水平。

这是一个**"消耗型"检测体系**,与大多数比色法(检测产物生成、吸光度升高)方向相反——这一点是新手操作时最容易困惑的地方,在第一篇选购指南中已专门提示。


第四步:为什么读两个时间点?读20 s和2 min 20 s的逻辑

KTB1120的操作要求是:

  • 混匀后第 20 s 读第一个吸光度值,记为 A₁
  • 等待反应进行,第 2 min 20 s 读第二个吸光度值,记为 A₂
  • 计算 ΔA = A₁ - A₂

为什么不从第0秒开始?

因为混匀操作本身需要时间,且混匀瞬间体系尚未达到均一状态,此时读数不稳定。等待20 s,让体系稳定后再读,A₁才是一个可靠的起点值。

为什么选2 min作为反应时长?

这是在反应动力学线性区内取点的标准做法。酶活检测要求在底物充足、反应速率恒定的线性阶段内取数据。反应初期(0~约3 min),底物PEP和NADH浓度远大于Km值,反应速率近似恒定,吸光度随时间线性下降。如果等待时间过长,底物消耗殆尽,反应进入"平台期",吸光度不再变化,此时再计算ΔA会严重低估PK活性。

2 min的设计,是在"信号足够大、仍处于线性区"这两个约束之间找到的最优平衡点。

说明书FAQ也提到:若样本ΔA < 0.005(活性过低),可以将反应时间延长至5 min或10 min——这正是利用了线性区时间窗口还有余量的原理。


第五步:常数3215从哪里来?——公式推导的完整逻辑

以按样本质量计算为例,说明书给出的简洁公式是:

PK (U/g) = 3215 × ΔA ÷ W

这个"3215"看起来像一个魔法数字,实际上是由一系列固定参数推导而来,每一个数字都有明确的物理意义:

参数数值含义
V反总2×10⁻⁴ L反应体系总体积(200 µL)
ε6.22×10³ L/mol/cmNADH摩尔消光系数
d0.5 cm96孔板光径
10⁹10⁹ nmol/mol单位换算:mol → nmol
V样0.01 mL加入样本体积(10 µL)
V样总1 mL加入Extraction Buffer体积
T2 min反应时间

推导过程:

第一步: 由朗伯-比尔定律,体系中NADH浓度变化量:

ΔC(NADH) = ΔA ÷ (ε × d) = ΔA ÷ (6.22×10³ × 0.5)  mol/L

第二步: 反应体系中NADH消耗的物质的量(nmol):

Δn(NADH) = ΔC × V反总 × 10⁹ = ΔA × 2×10⁻⁴ ÷ (6.22×10³ × 0.5) × 10⁹  nmol

第三步: 单位时间内消耗的NADH量(nmol/min):

速率 = Δn ÷ T = Δn ÷ 2

第四步: 换算到每g组织的PK活性(U/g),需除以样本量W,并考虑稀释倍数(V样总 ÷ V样 = 1 mL ÷ 0.01 mL = 100):

PK (U/g) = 速率 × (V样总 ÷ V样) ÷ W

将以上所有参数代入化简,最终得到:

PK (U/g) = ΔA × 2×10⁻⁴ × 10⁹ ÷ (6.22×10³ × 0.5 × 2) × 100 ÷ W

= 3215 × ΔA ÷ W

3215这个常数完全由试剂盒的固定参数决定。 只要检测体系参数不变(加样量、总体积、孔板光径、反应时间),这个常数就不变。这也是为什么说明书警告"不同批次、不同厂家组分不能混用"——一旦混用导致任何参数变化,用这个常数计算出的结果就会系统性偏差。


原理层面的两个常见误解

误解一:"LDH催化的是PK的逆反应,两者会相互干扰。"

不对。LDH和PK催化的底物完全不同:PK催化的是PEP和ADP,LDH催化的是丙酮酸和NADH。两者在底物上没有竞争,反应方向是串联的(PK的产物是LDH的底物),不存在干扰关系。

误解二:"NADH耦联法检测的其实是LDH活性,不是PK活性。"

这个误解来源于对"耦联"的错误理解。在试剂盒设计中,LDH是过量加入的,其催化速率远高于PK的催化速率,确保丙酮酸一旦生成就立即被LDH转化,不会积累。此时,整个体系的反应速率瓶颈在PK而不在LDH——限速步骤是PK。就像一条生产线上,后道工序的速度远快于前道工序,整条线的产量取决于前道,LDH在这里就是"绝不拖后腿的后道工序"。

进阶排雷:样本太"脏"时,自身就会消耗NADH怎么办?

上面的原理推导在理想状态下成立,但一旦遇到成分复杂的真实样本(最典型的是肝脏粗提液),就会碰到第三个问题:样本里不止有PK,还有一大堆其他内源性脱氢酶和代谢中间物。

动物组织裂解液中,MDH(苹果酸脱氢酶)、GAPDH(3-磷酸甘油醛脱氢酶)等多种内源性酶,即便在没有外加PEP底物的情况下,也可能以样本自带的代谢物为底物,缓慢消耗NADH,导致340 nm吸光度在无PK特异性催化的条件下仍然持续下降。

如果把这部分吸光度下降全部算在PK头上,计算出的PK活性就会系统性虚高。

解决方案是设置样本本底对照孔

孔型加样本加LDH加Substrate Mix(含PEP)
测定孔
本底对照孔✗(用等量Assay Buffer替代)

两组孔同步检测,分别计算各自的ΔA,最终用于计算PK活性的真实ΔA为:

ΔA真实 = ΔA测定孔 − ΔA本底孔

只有扣掉本底孔中内源性NADH消耗的部分,剩下的吸光度变化才真正代表PK的催化贡献。

需要说明的是,对于细胞样本、血清(浆)或来源较为单一的简单样本,内源性干扰通常在可接受范围内,常规实验不需要强制设置本底对照。但凡遇到以下情形,强烈建议加设本底孔:

  • 使用肝脏、肌肉等代谢酶丰富的组织粗提液
  • 预实验中发现ΔA异常偏高,稀释样本后问题仍未解决
  • 实验设计对PK活性绝对值要求严格(而非仅做组间相对比较)

这个原理为什么值得信赖?——文献应用的角度

PK-LDH耦联比色法已被多项高水平研究采用:

Chen等(2024)在研究MYG1驱动结直肠癌糖酵解的机制时,通过检测多个糖酵解酶活性(包括PK)来量化代谢重编程的程度,结果发表于 Nature Communications(2024, 15, 5202)。Su等(2024)研究猪流行性腹泻冠状病毒PDCoV如何将丙酮酸作为代谢枢纽劫持宿主糖酵解时,PK活性是核心检测指标之一,研究发表于 Redox Biology(2024, 71, 103118)。

这些工作的共同点:PK活性的定量数据直接支撑了代谢通量变化的核心论点,而数据的可信度,建立在NADH耦联法严格的化学计量学基础之上。


小结:原理链条的完整闭环

样本中的PK
    ↓ 催化(限速步骤)
PEP + ADP → 丙酮酸 + ATP
    ↓ LDH立即耦联(过量,不限速)
丙酮酸 + NADH → 乳酸 + NAD⁺
    ↓ NADH消耗,340 nm吸光度下降
酶标仪读取ΔA = A₁ - A₂
    ↓ 代入含固定常数3215的公式
输出PK活性(U/g / U/10⁴ / U/mL / U/mg prot)

每一个环节都有明确的生化依据,每一个参数都可以追溯到物理常数。理解了这条链条,就理解了为什么"测NADH能算出PK活性",也理解了为什么每个操作细节都不能随意更改。


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